O Jardim Botânico de Jundiaí possui uma biblioteca própria especializada, que conta com um acervo que abrange os temas: biologia vegetal, guias para identificação de plantas, restauração, agricultura, arborização, conservação, educação ambiental, Jardins Botânicos, Unidades de Conservação, educação ambiental, história, arte e periódicos científicos.
O acervo está disponível para consultas no local, sendo necessário contato prévio para agendamento da visita através de e-mail.